Главная -> Публикации ->

 

Саратиков А.С., Ахмеджанов Р.Р., Бакибаев А.А., Хлебников А.И.*, Новожеева Т.П., Быстрицкий Е.Л. Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений. – Томск, 2002

 

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ к главам 3 и 4

Литература к главам 1 и 2

194. Quantitative Structure–Activity Relatioships of Drugs / J.G.Topliss (ed.). – New York, 1983. – P. 1-21.

195. Раевский О.А., Сапегин А.М. Возможности и перспективы конструирования биологически активных веществ //Усп. химии. - 1988. - Т. 57. - С. 1565-1586.

196. Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. Топологические индексы в органической химии //Усп. химии. - 1988. - Т. 57. - С. 337-366.

197. Петелин Д.Е., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Топологические индексы для исследований в области QSAR и QSPR, основанные на весах вершин молекулярных графов //Докл. РАН. - 1992. - Т. 324. - С. 1019-1022.

198. Balaban A.T. Using real numbers as vertex invariants for third-generation topological indexes //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1992. - Vol. 32. - P. 23-28.

199. Topliss J.G., Edwards R.P.  Chance factors in studies of quantitative structure – activity relationships //J. Med. Chem. - 1979. - Vol. 22. - P. 1238-1244.

200. Wold S., Dunn III W.J. Multivariate quantitative structure – activity relationships (QSAR): conditions for their applicability //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1983. - Vol. 23. - P. 6-13.

201. Lin T.H., Yu Y.S., Chen H.J. Classification of some active compounds and their inactive analogues using two three-dimensional molecular descriptors derived from computation of three-dimensional convex hulls for structures theoretically generated for them //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 2000. - Vol. 40. - P.1210–1221.

202. Willett P.  A review of three-dimensional chemical structure retrieval systems //J. Chemom. - 1992. - Vol. 6. - P. 289-305.

203. Chang G., Guida W.C., Still W.C. An inertial coordinate Monte Carlo method for searching conformational space //J. Am. Chem. Soc. - 1989. - Vol. 111. - P. 4379-4386.

204. Gordeeva E.V., Katritzky A.R., Shcherbukhin V.V. et al. Rapid conversion of molecular graphs to three-dimensional representation using the MOLGEO program //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1993. - Vol. 33. - P. 102-111.

205. Nicklaus M.C., Milne G.W.A., Zaharevitz D. Chem-X and CAMBRIDGE. Comparison of computer generated chemical structures with X-ray crystallographic data //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1993. - Vol. 33. - P. 639–646.

206. DesJarlais R.L., Sheridan R.P., Seibel G.L. et al. Using shape complementarity as an initial screen in designing ligands for a receptor binding site of known three-dimensional structure //J. Med. Chem. - 1988. - Vol.31. - P. 722-729.

207. Fanelli F., Menziani M.C., Cocchi M. et al. The heuristic-direct approach to theoretical quantitative structure-activity relationship analysis of a1-adrenoceptor ligands //J. Mol. Struct. (Theochem). - 1994. - Vol. 314. - P. 265-276.

208. Crippen G.M.  Distance geometry approach to rationalizing binding data   //J. Med. Chem. - 1979. - Vol. 22. - P. 988-997.

209. Ghose A.K., Crippen G.M.  General distance geometry three-dimensional receptor model for diverse dihydrofolate reductase inhibitors //J. Med. Chem. - 1984. - Vol. 27. - P. 901-914.

210. Ghose A.K., Crippen G.M.  Use of physicochemical parameters in distance geometry and related three-dimensional quantitative structure-activity relationships: A demonstration using Escherichia coli dihydrofolate reductase inhibitors //J. Med. Chem. - 1985. - Vol. 28. - P. 333-346.

211. Jayatilleke P.R., Nair A.C., Zauhar R. et al.  Computational studies on HIV-1 protease inhibitors: influence of calculated inhibitor-enzyme binding affinities on the statistical quality of 3D-QSAR CoMFA models. //J. Med. Chem. - 2000. - Vol. 43. - P. 4446–4451.

212. Крутиус С.В., Кузьмин В.Е.  Моделирование ингибирующей активности триазинов Бейкера в рамках принципа структурного соответствия. //Хим.-фарм. журн. - 1986. - № 7. - С. 794-799.

213. Hopfinger A.J.  A QSAR  investigation of dihydrofolate reductase inhibition by Baker triazines based upon molecular shape analysis //J. Am. Chem. Soc. - 1980. - Vol. 102. - P. 7196-7206.

214. Cramer R.D. III, Patterson D.E., Bunce J.D. Comparative molecular field analysis (CoMFA). 1. Effect of shape on binding of steroids to carrier proteins //J. Am. Chem. Soc. - 1988. - Vol. 110. - P. 5959-5967.

215. Doweyko A.M.  The hypothetical active site lattice. An approach to modelling active sites from data on inhibitor molecules //J. Med. Chem. - 1988. - Vol. 31. -  P. 1396-1406.

216. Хлебников А.И.  Метод фронтальных многоугольников: новый подход к анализу взаимосвязи структура – биологическая активность //Хим.-фарм. журн. - 1994. - № 11. - С. 32-35.

217. Хлебников А.И. Алгоритм установления локального подобия молекул //Журн. структур. химии. - 1995. - Т. 36. - С. 1083-1087.

218. Баландин А.А. Избранные труды. - М., 1972. - С. 15–36.

219. Хлебников А.И., Пустовойтов А.В., Бакибаев А.А. и др.  Применение метода фронтальных многоугольников к анализу взаимосвязи структура – активность для производных мочевины – индукторов цитохрома Р-450 печени //Хим.-фарм. журн. - 1995. - № 7. - С. 24-29.

220. Хлебников А.И.  Метод фронтальных многоугольников для конформационно нежестких молекул. Взаимосвязь структура – активность в ряду триазинов Бейкера – ингибиторов дигидрофолатредуктазы //Хим.-фарм. журн. - 1997. - № 3. - С. 41-48.

221. Kantola A., Villar H.O., Loew G.H.  Atom based parametrization for a conformationally dependent hydrophobic index //J. Comput. Chem. - 1991. - Vol. 12. - P. 681-689.

222. Glen W.G., Dunn III W.J., Scott D.R.  Principal components analysis and partial least squares regression //Tetrahedron Comput. Methodol. - 1989. - Vol. 2. - P. 349-376.

223. Lindberg W., Persson J.-A., Wold S.  Partial least-squares method for spectrofluorimetric analysis of mixtures of humic acid and ligninsulfonate //Anal. Chem. - 1983. - Vol. 55. - P. 643-648.

224. Cramer  R.D. III. Partial least squares (PLS): its strength and limitations, Perspect. Drug Discovery Des., 1, 269–278 (1993); Chem. Abstr., 120, 260534 (1994).

225. Rogers D., Hopfinger A.J. Application of genetic function approximation to quantitative structure-activity relationships and quantitative structure-property relationships //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P. 854-866.

226. Waller C.L., Marshall G.R. Three-dimensional quantitative structure-activity relationship of angiotensin-converting enzyme and thermolysin inhibitors. II. A comparison of CoMFA models incorporating molecular orbital fields and desolvation free energies based on active-analog and complementary-receptor-field alignment rules //J. Med. Chem. - 1993. - Vol. 36. - P. 2390–2403.

227. Вилков Л.В., Мастрюков В.С., Садова Н.И. Определение геометрического строения свободных молекул. - Ленинград, 1978. - 224 с.

228. Каганюк Д.С., Кыскин В.И., Дашевский В.Г. О распределении электронной плотности и прочности отдельных связей в соединениях фосфора //Докл. АН СССР. - 1979. - Т. 248, N 6. - С. 1366-1370.

229. Хлебников А.И., Ахмеджанов Р.Р., Набока О.И. и др.  Количественные соотношения структура – константа диссоциации для комплексов микросомального цитохрома Р-450 с некоторыми производными мочевины, дифенила, дифенилметана и карбамидсодержащими гетероциклами //Хим.-фарм. журн. - 1999. - № 12. - С. 17-23.

230 Хлебников А.И., Пустовойтов А.В., Овсянников А.И. Комплекс программ для конформационного анализа с различными силовыми полями // Изв. вузов. Химия и хим. технол. - 1996. - Т.39, вып. 4-5. - С. 44-49.

231. Дашевский В.Г. Конформации органических молекул. - М., 1974. - 432 с.

232. HyperChemTM. Molecular Modeling System. Release 2 (1991). Hypercube, Inc. and Autodesk, Inc.

233. Хлебников А.И. Синтез, строение и реакционная способность некоторых N-гетарилэтиленов и соединений на их основе. – Дисс… докт. хим. наук. – Барнаул, 2000. – 317 с.

234. Хлебников А.И., Пустовойтов А.В., Бакибаев А.А и др. Количественные соотношения структура - активность для индукторов цитохрома Р-450 фенобарбиталового типа //Хим.-фарм. журн. - 1998. - № 7. - С. 35-41.

235. Бакибаев А.А., Филимонов В.Д., Кужелева и др. Синтетические антиконвульсанты, антигипоксанты и индукторы монооксигеназной системы печени на основе амидов и мочевин. II. Синтез, противосудорожные, антигипоксические и ферментиндуцирующие свойства N-трифторацетильных производных бензгидриламинов //Хим.-фарм. журн. - 1992. - № 11-12. - С. 36 – 39.

236. Ахмеджанов Р.Р., Хлебников А.И., Набока О.И. и др. Спектральное исследование ферментсубстратных комплексов некоторых биологически активных соединений с цитохромом Р-450 и внеэкспериментальное прогнозирование констант диссоциации этих комплексов // В печати.

237. Скворцова М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. Генерация молекулярных структур поликонденсированных бензоидных углеводородов по индексу Рандича //Ж. структур. химии. - 1992. - Т. 33. - С. 99-104.

238. Витюк Н.В. «Цепные» топологические индексы для решения прямой и обратной задач «структура–свойство» //Ж. физ. химии. - 1993. - Т. 67. - С. 2019-2022.

239. Kier L.B., Hall L.H. The generation of molecular structures from a graph-based QSAR equation //Quant. Struct.-Act. Relat. - 1993. - Vol. 12. - P. 383-388.

240.  Brown R.D., Jones G., Willett P. et al. Matching two-dimensional chemical graphs using genetic algorithms //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P.63-70.

241. DuBois J.-E., Carrier G., Panaye A.  DARC topological descriptors for pattern recognition in molecular database management systems and design //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1991. - Vol. 31. - P. 574-578.

242. Martin Y.C. 3D database searching in drug design //J. Med. Chem. - 1992. - Vol. 35. - P. 2145–2154.

243. Moock T.E., Henry D.R., Ozkabak A.G. et al. Conformational searching in ISIS/3D databases //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P. 184-189.

244. Christie B.D., Henry D.R., Wipke W.T. et al. Database structure and searching in MACCS-3D //Tetrahedron Comput. Methodol. - 1990. - Vol. 3. - P. 653-664.

245. Rotstein S.H., Murcko M.A. GenStar: a method for de novo drug design   //J. Comput.-Aided Mol. Des. - 1993. - Vol. 7. - P. 23-43.

246. Lewis R.A., Roe D.C., Huang C. et al. Automated site-directed drug design using molecular lattices //J. Mol. Graphics. - 1992. - Vol. 10. - P. 66-78, 106.

247. Eisen M.B., Wiley D.C., Karplus M. et al. HOOK: a program for finding novel molecular architectures that satisfy the chemical and steric requirements of a macromolecule binding site //Proteins: Struct., Funct., Genet. - 1994. - Vol. 19. - P. 199-221.

248. Gillet V.J., Johnson A.P., Mata P. et al.  Automated structure design in 3D //Tetrahedron Comput. Methodol. - 1990. - Vol. 3. - P. 681-696.

249. Moon J.B., Howe W.J. Computer design of bioactive molecules: a method for receptor-based de novo ligand design //Proteins: Struсt., Funct., Genet. - 1991. - Vol. 11. - P. 314-328.

250. Simon Z. Specific interactions. Intermolecular forces, steric requirements, and molecular size //Angew. Chem., Int. Ed. Eng. - 1974. - Vol. 13, № 11. - P. 719-727.

251. Хлебников А.И.  Алгоритм оптимального построения химических структур из молекулярных фрагментов //Журн. структур. химии. - 1998. - Т. 39, № 4. - С. 698-707.

252. Лекции по теории графов /В.А.Емеличев, О.И. Мельников, В.И. Сарванов. и др. - М., 1990. - 384 с.

253. Зыков А.А. Гиперграфы // Успехи матем. наук. - 1974. - Т. 29, вып. 6. - С. 80-154.

254. Aubrecht J., Hirsch-Ernst K.I., Foth H. Differential induction of mRNA expression of cytochromes P450 (CYP2B1 and CYP1A1/2) by metyrapone in primary rat hepatocyte cultures //Res. Commun. Mol. Pathol. Pharmacol. - 1996. - Vol. 94, № 1. - P. 47–61.

255. Luu-The V., Cumps J., Dumont P. Metyrapone – reduced cytochrome P450 complex: a specific method for the determination of the phenobarbital inducible form of rat hepatic microsomal cytochrome P450 //Biochem. biophys. res. commun. - 1980. - Vol. 93, № 3. - P. 776–781.

256. Lu A.Y.H., Kuntzman R., West S. Reconstituted liver microsomal enzyme system that hydroxylates drugs other foreign compounds, and endogenous substrates //J. Biol. Chem. - 1972. - Vol. 247. - P. 1727–1733.

  

Рейтинг@Mail.ru