Главная -> Публикации ->
Саратиков А.С., Ахмеджанов
Р.Р., Бакибаев А.А., Хлебников А.И.*, Новожеева
Т.П., Быстрицкий Е.Л. Регуляторы ферментативных систем
детоксикации среди азотсодержащих соединений.
– Томск, 2002
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ к главам 3 и 4
194. Quantitative Structure–Activity Relatioships of
Drugs / J.G.Topliss (ed.). –
195. Раевский О.А., Сапегин А.М. Возможности и перспективы конструирования биологически активных веществ //Усп. химии. - 1988. - Т. 57. - С. 1565-1586.
196. Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров
Н.С. Топологические индексы в органической химии //Усп. химии. - 1988. - Т. 57. - С. 337-366.
197. Петелин Д.Е., Палюлин В.А.,
Зефиров Н.С. Топологические индексы для исследований в области QSAR и QSPR,
основанные на весах вершин молекулярных графов //Докл. РАН. - 1992. - Т. 324. - С. 1019-1022.
198. Balaban A.T. Using real numbers as vertex invariants
for third-generation topological indexes //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1992. - Vol. 32. - P. 23-28.
199. Topliss J.G., Edwards R.P. Chance factors in studies of quantitative
structure – activity relationships //J. Med. Chem. - 1979. - Vol. 22. - P. 1238-1244.
200. Wold S., Dunn III W.J. Multivariate quantitative
structure – activity relationships (QSAR): conditions for their applicability
//J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1983. - Vol. 23. - P. 6-13.
201. Lin T.H., Yu Y.S., Chen H.J. Classification of some active compounds and their inactive analogues
using two three-dimensional molecular descriptors derived from computation of
three-dimensional convex hulls for structures theoretically generated for them
//J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 2000. - Vol. 40. - P.1210–1221.
202. Willett P. A
review of three-dimensional chemical structure retrieval systems //J. Chemom. - 1992. - Vol. 6. - P. 289-305.
203. Chang G., Guida W.C., Still W.C. An inertial
coordinate
204. Gordeeva E.V., Katritzky A.R., Shcherbukhin V.V. et
al. Rapid conversion of molecular graphs to three-dimensional representation
using the MOLGEO program //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1993. - Vol. 33. - P. 102-111.
205. Nicklaus M.C., Milne G.W.A., Zaharevitz D. Chem-X
and
206. DesJarlais R.L., Sheridan R.P., Seibel G.L. et al.
Using shape complementarity as an initial screen in designing ligands for a
receptor binding site of known three-dimensional structure //J. Med. Chem. - 1988. - Vol.31. - P. 722-729.
207. Fanelli F., Menziani M.C., Cocchi M. et al. The
heuristic-direct approach to theoretical quantitative structure-activity
relationship analysis of a1-adrenoceptor
ligands //J. Mol. Struct. (Theochem). - 1994. - Vol. 314. - P. 265-276.
208. Crippen G.M.
Distance geometry approach to rationalizing binding data //J. Med. Chem. - 1979. - Vol. 22. - P. 988-997.
209. Ghose A.K., Crippen G.M. General distance geometry three-dimensional
receptor model for diverse dihydrofolate reductase inhibitors //J. Med. Chem. - 1984. - Vol. 27. - P. 901-914.
210. Ghose A.K., Crippen G.M. Use of physicochemical parameters in distance
geometry and related three-dimensional quantitative structure-activity
relationships: A demonstration using Escherichia
coli dihydrofolate reductase inhibitors //J. Med. Chem. - 1985. - Vol. 28. - P. 333-346.
211. Jayatilleke P.R., Nair A.C., Zauhar R. et al. Computational
studies on HIV-1 protease inhibitors: influence of calculated inhibitor-enzyme
binding affinities on the statistical quality of 3D-QSAR CoMFA models. //J.
Med. Chem. - 2000. - Vol. 43. - P. 4446–4451.
212. Крутиус С.В., Кузьмин В.Е. Моделирование ингибирующей активности
триазинов Бейкера в рамках принципа структурного соответствия. //Хим.-фарм.
журн. - 1986. - № 7. - С. 794-799.
213. Hopfinger A.J.
A QSAR investigation of
dihydrofolate reductase inhibition by Baker triazines based upon molecular shape
analysis //J. Am. Chem. Soc. - 1980. - Vol. 102. - P. 7196-7206.
214. Cramer R.D. III, Patterson D.E., Bunce J.D.
Comparative molecular field analysis (CoMFA). 1. Effect of shape on binding of
steroids to carrier proteins //J. Am. Chem. Soc. - 1988. - Vol. 110. - P. 5959-5967.
215. Doweyko A.M.
The hypothetical active site lattice. An approach to modelling active
sites from data on inhibitor molecules //J. Med. Chem. - 1988. -
Vol. 31. - P. 1396-1406.
216. Хлебников А.И. Метод фронтальных многоугольников: новый
подход к анализу взаимосвязи структура – биологическая активность //Хим.-фарм.
журн. - 1994. - № 11. - С. 32-35.
217. Хлебников А.И. Алгоритм
установления локального подобия молекул //Журн. структур. химии. - 1995. - Т. 36. - С. 1083-1087.
218. Баландин А.А. Избранные труды. - М., 1972. - С. 15–36.
219. Хлебников А.И., Пустовойтов А.В.,
Бакибаев А.А. и др. Применение метода
фронтальных многоугольников к анализу взаимосвязи структура – активность для
производных мочевины – индукторов цитохрома Р-450 печени //Хим.-фарм. журн. - 1995. - № 7. - С. 24-29.
220. Хлебников А.И. Метод фронтальных многоугольников для
конформационно нежестких молекул. Взаимосвязь структура – активность в ряду
триазинов Бейкера – ингибиторов дигидрофолатредуктазы //Хим.-фарм. журн. - 1997. - № 3. - С. 41-48.
221. Kantola A., Villar H.O., Loew G.H. Atom based parametrization for a
conformationally dependent hydrophobic index //J. Comput. Chem. - 1991. - Vol. 12. - P. 681-689.
222. Glen W.G., Dunn III W.J., Scott D.R. Principal components analysis and partial
least squares regression //Tetrahedron Comput. Methodol. - 1989. - Vol. 2. - P. 349-376.
223. Lindberg W., Persson J.-A., Wold S. Partial least-squares method for
spectrofluorimetric analysis of mixtures of humic acid and ligninsulfonate
//Anal. Chem. - 1983. - Vol. 55. - P. 643-648.
224. Cramer R.D.
III. Partial least squares (PLS): its strength and limitations, Perspect. Drug
Discovery Des., 1, 269–278 (1993); Chem.
Abstr., 120, 260534 (1994).
225. Rogers D., Hopfinger A.J. Application of genetic
function approximation to quantitative structure-activity relationships and
quantitative structure-property relationships //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P. 854-866.
226. Waller C.L., Marshall G.R. Three-dimensional
quantitative structure-activity relationship of angiotensin-converting enzyme
and thermolysin inhibitors. II. A comparison of CoMFA models incorporating
molecular orbital fields and desolvation free energies based on active-analog
and complementary-receptor-field alignment rules //J. Med. Chem. - 1993. - Vol. 36. - P. 2390–2403.
227. Вилков Л.В., Мастрюков В.С.,
Садова Н.И. Определение геометрического строения свободных молекул. - Ленинград, 1978. - 224 с.
228. Каганюк Д.С., Кыскин В.И.,
Дашевский В.Г. О распределении электронной плотности и прочности отдельных
связей в соединениях фосфора //Докл. АН СССР. - 1979. - Т. 248, N 6. - С. 1366-1370.
229. Хлебников А.И., Ахмеджанов Р.Р., Набока О.И. и др. Количественные соотношения структура –
константа диссоциации для комплексов микросомального цитохрома Р-450 с
некоторыми производными мочевины, дифенила, дифенилметана и карбамидсодержащими
гетероциклами //Хим.-фарм. журн. - 1999. - № 12. - С. 17-23.
230 Хлебников А.И., Пустовойтов А.В., Овсянников А.И.
Комплекс программ для конформационного анализа с различными силовыми полями //
Изв. вузов. Химия и хим. технол. - 1996. - Т.39, вып.
4-5. - С. 44-49.
231. Дашевский В.Г. Конформации органических молекул. - М., 1974. - 432 с.
232. HyperChemTM. Molecular
Modeling System. Release 2 (1991). Hypercube, Inc. and Autodesk, Inc.
233. Хлебников А.И. Синтез, строение и реакционная
способность некоторых N-гетарилэтиленов
и соединений на их основе. – Дисс… докт. хим. наук. – Барнаул, 2000. – 317 с.
234. Хлебников А.И., Пустовойтов А.В., Бакибаев А.А и др.
Количественные соотношения структура - активность для индукторов цитохрома Р-450 фенобарбиталового
типа //Хим.-фарм. журн. - 1998. - № 7. - С. 35-41.
235. Бакибаев А.А., Филимонов В.Д., Кужелева и др.
Синтетические антиконвульсанты, антигипоксанты и индукторы монооксигеназной
системы печени на основе амидов и мочевин. II. Синтез, противосудорожные, антигипоксические и
ферментиндуцирующие свойства N-трифторацетильных
производных бензгидриламинов //Хим.-фарм. журн. - 1992. - № 11-12. - С. 36 – 39.
236. Ахмеджанов Р.Р., Хлебников А.И., Набока О.И. и др.
Спектральное исследование ферментсубстратных комплексов некоторых биологически
активных соединений с цитохромом Р-450 и внеэкспериментальное прогнозирование
констант диссоциации этих комплексов // В печати.
237. Скворцова М.И., Станкевич И.В.,
Зефиров Н.С. Генерация молекулярных структур поликонденсированных бензоидных
углеводородов по индексу Рандича //Ж. структур. химии. - 1992. - Т. 33. - С. 99-104.
238. Витюк Н.В. «Цепные»
топологические индексы для решения прямой и обратной задач «структура–свойство»
//Ж. физ. химии. - 1993. - Т. 67. - С. 2019-2022.
239. Kier L.B., Hall L.H. The generation of molecular
structures from a graph-based QSAR equation //Quant. Struct.-Act. Relat. - 1993. - Vol. 12. - P. 383-388.
240. Brown R.D.,
Jones G., Willett P. et al. Matching two-dimensional chemical graphs using
genetic algorithms //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P.63-70.
241. DuBois J.-E., Carrier G., Panaye A. DARC topological descriptors for pattern
recognition in molecular database management systems and design //J. Chem. Inf.
Comput. Sci. - 1991. - Vol. 31. - P. 574-578.
242. Martin Y.C. 3D database searching in drug design
//J. Med. Chem. - 1992. - Vol. 35. - P. 2145–2154.
243. Moock T.E., Henry D.R., Ozkabak A.G. et al.
Conformational searching in ISIS/3D databases //J. Chem. Inf. Comput. Sci. - 1994. - Vol. 34. - P. 184-189.
244. Christie B.D., Henry D.R., Wipke W.T. et al.
Database structure and searching in MACCS-3D //Tetrahedron Comput. Methodol. - 1990. - Vol. 3. - P. 653-664.
245. Rotstein S.H., Murcko M.A. GenStar: a method for de
novo drug design //J. Comput.-Aided
Mol. Des. - 1993. - Vol. 7. - P. 23-43.
246. Lewis R.A., Roe D.C., Huang C. et al. Automated
site-directed drug design using molecular lattices //J. Mol. Graphics. - 1992. - Vol. 10. - P. 66-78, 106.
247. Eisen M.B.,
248. Gillet V.J., Johnson A.P., Mata P. et al. Automated structure design in 3D
//Tetrahedron Comput. Methodol. - 1990. - Vol. 3. - P. 681-696.
249. Moon J.B., Howe W.J. Computer design of bioactive
molecules: a method for receptor-based de novo ligand design //Proteins:
Struсt., Funct., Genet. - 1991. - Vol. 11. - P. 314-328.
250. Simon Z. Specific interactions. Intermolecular
forces, steric requirements, and molecular size //Angew. Chem., Int. Ed. Eng. - 1974. -
Vol. 13, № 11. -
P. 719-727.
251. Хлебников А.И. Алгоритм оптимального построения химических
структур из молекулярных фрагментов //Журн. структур. химии. - 1998. - Т. 39, № 4. - С. 698-707.
252. Лекции по теории графов
/В.А.Емеличев, О.И. Мельников, В.И. Сарванов. и др. - М., 1990. - 384 с.
253. Зыков А.А. Гиперграфы // Успехи
матем. наук. - 1974. - Т. 29, вып. 6. - С. 80-154.
254. Aubrecht J., Hirsch-Ernst K.I., Foth H. Differential
induction of mRNA expression of cytochromes P450 (CYP2B1 and CYP1A1/2) by
metyrapone in primary rat hepatocyte cultures //Res. Commun. Mol. Pathol.
Pharmacol. - 1996. - Vol. 94, № 1. - P. 47–61.
255. Luu-The V., Cumps J., Dumont P. Metyrapone – reduced
cytochrome P450 complex: a specific method for the determination of the
phenobarbital inducible form of rat hepatic microsomal cytochrome P450
//Biochem. biophys. res. commun. - 1980. - Vol. 93, № 3. - P. 776–781.
256. Lu A.Y.H., Kuntzman R.,
West S. Reconstituted liver microsomal enzyme system that hydroxylates drugs
other foreign compounds, and endogenous substrates //J. Biol. Chem. - 1972. - Vol. 247. - P. 1727–1733.